En 1973, pasó a trabajar a la Dirección General de Geología y Geofísica, nombrado luego director de la Unión de Empresas Perforación y Extracción de Petróleo. A partir de 1982 es nombrado al frente de la Empresa de Petróleo de Pinar del Rio con sede en Santa Lucia. Lidereó la industria en sus momentos de expansión en los años ochenta. Desde 1989 se comienzan las negociaciones para la firma de contratos de asociación con empresas internacionales. Contrario a todos los pronósticos y gracias a un enorme esfuerzo de capacitación y el apoyo de la más alta dirección del país fue posible firmar el primer acuerdo en enero de 1990. El incremento de la actividad de contratación internacional lleva en 1992 a la creación de la empresa Comercial Cupet con Juan Alfonso Fleites Melo como su primer gerente general. A partir de entonces las habilidades negociadoras y la fortaleza de los conocimientos llevan a la firma exitosa de más de cuarenta contratos de asociación económica internacional tanto en el sector de exploración producción como en la refinación y la transportación de hidrocarburos. En 2012 se retiró después de 53 años de trabajo ininterrumpido y trayectoria intachable.